Tujuan BPMI Universitas Doktor Nugroho adalah

1. Meningkatkan kualitas dari sistem pendidikan dengan fokus menghasilkan lulusan Universitas Doktor Nugroho Magetan berkualitas yang mampu mengembangkan ilmu pengetahuan, teknologi, humaniora, seni dan budaya yang mampu menciptakan lapangan kerja

2. Meningkatkan kegiatan penelitian dengan fokus menghasilkan penelitian inovatif yang mendorong pengembangan ilmu pengetahuan, teknologi, humaniora, seni dan budaya dalam skala nasional

3. Meningkatkan kegiatan pengabdian masyarakat dengan fokus mampu memperdayakan masyarakat yang sadar lingkungan dan mampu menyelesaikan secara mandiri dan berkelanjutan

Prinsip yang dilakukan BPMI Universitas Doktor Nugroho Magetan adalah

1. Berorientasi pada peningkatan kualitas Tridharma Perguruan Tinggi.

2. Kerja maksimal untuk peningkatan mutu lembaga

3. Tanggung jawab sosial